Модуль TPM функционирует на основе своего собственного программного обеспечения, что делает его независимым от той ОС, в которой он используется. Он способен принимать и выполнять команды, хранить данные и выдавать их по запросу. Наличие криптопроцессора позволяет TPM генерировать случайные числа, ключи шифрования и цифровые подписи, вычислять хэши и шифровать данные. Зачастую TPM используют такие средства полнодискового шифрования как BitLocker. Благодаря особенностям шифрования ключей модулем TPM, во многих случаях воспользоваться компьютером без непосредственного использования модуля невозможно.
В функционале TPM также есть возможность контролировать состояние системы. Модуль анализирует системы на наличие признаков вторжения в его аппаратное и программное обеспечение. Если фиксируются какие-либо изменения, модуль может закрыть доступ к защищаемой информации.